Keanekaragaman organisme hidup di Indonesia begitu luas, sehingga diperlukan cabang biologi khusus untuk mempelajarinya. Dalam hal ini menjadi tugas ilmu taksonomi, yang dapat didefinisikan sebagai teori dan praktek mengklasifikasikan organisme. Ahli taksonomi bekerja mengklasifikasikan tanaman dan hewan ke dalam kelompok spesies terkait.

Mereka memberikan nama formal untuk kelompok-kelompok ini untuk setiap spesies individu. Contoh kelompok hewan terkait adalah serangga, yang memiliki karakteristik tertentu, seperti enam kaki.
Referensi berupa koleksi merupakan sumber penting dalam penelitian terapan. Koleksi (insectarium) dapat digeneralisasikan atau dispesialisasikan, dan dapat berkembang sangat besar hingga mengandung ribuan spesimen. Museum biologi yang umumnya menampung spesimen. Koleksinya mewakili beberapa atau semua spesies yang ada di wilayah geografis tertentu, karena salah satu tujuan mereka adalah mengumpulkan bahan untuk studi keanekaragaman hayati.

Lembaga yang terlibat dalam bidang-bidang seperti pekerjaan hama tanaman, penelitian pengendalian biologis, balai kesehatan-pertanian, dan lain sebagainya miliki koleksi lebih khusus yang relevan dengan tujuan mereka. Contoh dari koleksi referensi adalah:Serangga atau kutu yang ditemukan pada spesies tumbuhan tertentu
• Nyamuk yang menggigit manusia di negara tertentu
• Lebah parasit yang menyerang serangga sisik pada tanaman
• Arthropoda ditemukan dalam kargo biji-bijian di kapal di pelabuhan

Koleksi spesimen yang diidentifikasi, diberi label dengan benar dan diatur
dalam sistem penyimpanan yang baik agar memiliki fungsi penting sebagai
berikut:
• Mereka dapat digunakan untuk mengkonfirmasi identifikasi materi lebih lanjut
• Voucher spesimen, atau materi yang diterbitkan berbasis studinya, dapat disimpan dalam koleksi untuk referensi di masa mendatang
• Nama spesies baru didasarkan pada referensi spesimen yang dikenal sebagai jenis, dan disimpan dalam koleksi yang sesuai serta mapan, di museum
• Spesimen biologis dan data terkait berfungsi sebagai arsip informasi tentang banyak topik, seperti distribusi, tanaman inang, dan kejadian musiman spesies.